General-IDのブログ

神戸で感染症内科医をやっています。日々勉強したことを共有しています。基本的に、感染症に関連した内容です。所属施設の公式見解ではありませんので、その点はご了承ください。

検査

唾液SARS-CoV-2 PCR検査の精度

唾液SARS-CoV-2 PCR検査の精度 まとめ 有症状者のCOVID-19診断において、鼻咽頭ぬぐい液PCRをreference standardとした場合の唾液PCRは、感度80-90%・特異度95%程度と報告されている。患者への侵襲度が低く、医療従事者への感染のリスクも低いことから、今後…

COVID-19診断におけるPCRの偽陰性

COVID-19診断におけるPCRの偽陰性 Variation in False-Negative Rate of Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction–Based SARS-CoV-2 Tests by Time Since Exposure. https://doi.org/10.7326/M20-1495. https://www.acpjournals.org/doi/10.7326/M2…

COVID-19:SARS-CoV-2抗体検査について

COVID-19:SARS-CoV-2抗体検査について まとめ ・IgMとIgGは、発症2週目から上昇し始める ・発症10-14日目でIgGの感度は90%以上(reference standardはRT-PCR検査)となる ・急性期の診断に、あまり有用ではない ・検査方法、キットの種類によって、精度が異…

COVID-19時代の気管支鏡検査についてのガイダンス

COVID-19時代の気管支鏡検査についてのガイダンス The Use of Bronchoscopy During the COVID-19 Pandemic. CHEST/AABIP Guideline and Expert Panel Report. Chest. 2020 May 1. pii: S0012-3692(20)30850-3. doi: 10.1016/j.chest.2020.04.036. https://jo…

SARS-CoV-2抗原検査

SARS-CoV-2抗原検査について調べてみました まとめ ・SARS-CoV-2抗原検査のdataはまだ非常に少ない(まだ文献化されていない) ・検査材料は、鼻咽頭ぬぐい液で、検査時間は30分以内である ・ウイルス量が多ければ感度は高くなるが、PCR検査より感度が劣る …

気道検体のSARS-CoV-2 PCR検査:診断のために複数回必要な症例がある

江蘇省におけるCOVID-19 80例の臨床的特徴 https://doi.org/10.1093/cid/ciaa199 https://academic.oup.com/cid/advance-article/doi/10.1093/cid/ciaa199/5766408?searchresult=1 【方法】 ・後ろ向き観察研究、江蘇省の3つの3次医療機関 ・確定COVID-19患…

シンガポールでのCOVID-19の疫学的・臨床的特徴

シンガポールでのCOVID-19の疫学的・臨床的特徴 Young BE, Ong SWX, Kalimuddin S, et al. Epidemiologic Features and Clinical Course of Patients Infected With SARS-CoV-2 in Singapore. JAMA. Published online March 3, 2020. doi: 10.1001/jama.2020…

一度陰性化した咽頭スワブのSARS-CoV-2 PCRが再度陽性化した報告

一度陰性化した咽頭スワブのSARS-CoV-2 PCRが再度陽性化した報告 JAMA. 2020 Feb 27 doi: 10.1001/jama.2020.2783 https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2762452 ・4人のCOVID-19患者(医療者、1名は入院、3名は在宅療養)を対象 ・男性2名、…

唾液からのSARS-CoV-2の検出

唾液からのSARS-CoV-2の検出 Clin Infect Dis. 2020 Feb 12. doi: 10.1093/cid/ciaa149 https://academic.oup.com/cid/advance-article/doi/10.1093/cid/ciaa149/5734265 【方法】 ・患者自身が採取した唾液のウイルス量(RT-PCR)を測定 ・COVID-19の確定診…

COVID-19患者の上気道検体のウイルス量

COVID-19患者の上気道検体のウイルス量 N Engl J Med. 2020 Feb 19. doi: 10.1056/NEJMc2001737 https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMc2001737?url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori:rid:crossref.org&rfr_dat=cr_pub%3dpubmed 【方法】 ・広東省珠海市のS…

臨床検体のSARS-CoV-2のウイルス量

臨床検体のSARS-CoV-2のウイルス量 Lancet Infect Dis. 2020 Feb 24. doi: 10.1016/S1473-3099(20)30113-4 https://www.thelancet.com/journals/laninf/article/PIIS1473-3099(20)30113-4/fulltext ・北京の2名の患者のdataの詳細 患者1:発症後3-12日、毎日…

耳鏡よりも「耳かきカメラ」!?

前の職場の先輩がSNSで、「耳かきカメラ」について投稿していたので、自分でも買ってみました。 明らかに、通常の耳鏡より鼓膜の観察が容易です。wifi接続可能で、画像はiPhoneでみることができて、写真もとれるので、非常に便利です。 利点 ・鼓膜をはっき…

血液培養陽性例における原因菌同定と薬剤感受性試験結果が早く出ることによってどのような効果が得られるか?

【前提条件として、MALDI TOF MSの導入と充実したASPが存在する場合、血液培養陽性例でADXより早期に同定・薬剤感受性結果が出ても予後は改善しない】 血液培養陽性例におけるAccelerate Pheno system(ADX)の導入の効果を検討した観察研究。ADXによって、9…

E. coli、Klebsiella spp.、P. mirabilisにおけるCTRX非感性株は、ESBL産生株とは限らない

【E. coliなどのCTRX非感性は、必ずしもESBL産生を意味しない】 内容:E. coli, K. pneumoniae, K. oxytoca, P. mirabilisでCTRX MIC≧2 µg/mLの臨床株(カルバペネム非感株は除外)のβ-lactamase遺伝子を解析した。米国の1つの病院(Johns Hopkins Hospital…

βラクタム系抗菌薬で治療中の腸内細菌科細菌の形態

K. pneumoniaeによる持続菌血症(骨髄炎)をertapenemで治療中に採取した血液培養のグラム染色像。K. pneumoniaeだが、中央部が膨らんだグラム陽性桿菌に見える。 Morphological changes induced by β-lactam antibiotics observed on Gram stainingClin Mic…

zone edge testについてのメモ

S. aureusのペニシリン感受性を調べるための検査であるzone edge testについてのメモ(なぐり書き)です。興味ある人は、原著にあたってください。blaZ、PSSA、CLSI、EUCASTなど感染症領域の人以外には見慣れない用語が多くなっていますが、ご了承ください。…